2008年是深入贯彻党的十七大精神、切实落实科学发展观、着力构建和谐社会的重要一年。上海审计工作要以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，以深入学习贯彻党的十七大精神为动力，全面把握市委九届三次全会和全国审计工作会议精神实质，继续坚持“依法审计、服务大局、围绕中心、突出重点、求真务实”的方针，全面履行审计监督职责，严肃查处重大违法违规问题和经济犯罪，增加对权力的监督实效，加强对体制性、机制性和制度性问题的综合分析，促进行政管理体制改革，更好地为推进以改善民生为重点的社会建设、社会主义新农村建设和社会主义和谐社会建设发挥积极作用，切实推动上海经济社会又好又快地发展。
2008年上海审计工作的主要任务和重点：一是加强预算执行审计，完善转移支付制度，促进政府部门依法行政和科学管理，推动行政管理体制改革，为建设服务政府、责任政府、法治政府服务；二是加强对关系人民群众切身利益的卫生、医疗、社保和关系经济社会发展的科技、环保、农业以及关系政府部门发展的政府采购等专项资金的审计和审计调查，促进以改善民生为重点的社会建设和以加强政府管理的政府自身建设，推进经济社会可持续发展和社会主义和谐社会建设；三是加强对重点投资项目的审计，促进提高资金使用效益，推进城市协调发展；四是加强经济责任审计，强化对权力运行的监督，促进反腐倡廉，推进民主政治建设；五是加强效益审计，注重查处损失浪费，促进转变经济增长方式，提高财政资金使用效益和资源利用效率、效果，建设资源节约型社会，促进社会和谐发展。
根据上述要求，2008年市审计局重点审计项目计划安排如下：
一、财政收支审计
1．市财政局组织2007年度市本级预算执行情况审计。对市财政局组织2007年度市本级预算执行情况进行审计。通过审计，促进规范预算管理和转移支付资金管理，完善预算管理制度，推进基本公共服务能力均衡化，切实增强基层政府提供公共服务能力，进一步健全公共财政体系，不断提高财政资金使用效益。
2．市地方税务局2007年度地方税收征管情况审计。对市地方税务局及部分区县税务局2007年度地方税收征管情况的审计。通过审计，强化对税收征收管理的监督，促进税务部门进一步规范税收征收行为，完善税收征收管理政策，不断提高税收征管质量。
3．市级部门2007年度预算执行情况审计。2008年安排对部分市级部门2007年度预算执行情况进行审计。通过审计，进一步促进主管部门加强对下属单位的监督和管理，规范部门预算管理，推进政府部门依法行政和科学管理，推动行政管理体制改革，为建设服务政府、责任政府、法治政府服务。具体审计单位是：市人民政府机关事务管理局、市知识产权局、市文化艺术界联合会、市卫生局、上海申康医院发展中心、市科学技术协会、市人民政府发展研究中心、市残疾人联合会、市环境保护局、市对外经济贸易委员会、市旅游事业管理委员会、市文化广播影视管理局、市科学技术委员会、市新闻出版局、上海社会科学院、市港口管理局、市房屋土地资源管理局、市民防办公室、市司法局、市监狱管理局、市劳动教养工作管理局。
4.市级部门2007年度决算(草案)审计。围绕市级预算执行审计总体要求，以规范部门预算管理和决算编报为目标，对市卫生局、市环境保护局、市港口管理局、市民防办公室、市司法局部门决算(草案)进行审计。通过审计，促进提升部门决算(草案)编报质量。
二、效益审计
5．残疾人就业保障金筹集、使用和管理情况审计。以规范残疾人就业保障金的分配和支出管理，提升资金的使用效果，促进完善管理制度，推动残疾人保障事业的顺利发展为目标，对本市2007年度残疾人就业保障金筹集、使用和管理情况进行审计。通过审计，促进完善残疾人就业保障金管理制度，推动国家和本市的有关政策和制度的有效落实，切实保障残疾人的合法权益，不断推进社会主义和谐社会建设。
6．农业综合开发项目和资金使用、管理情况审计。以规范涉农资金的投入、使用和管理，提高资金使用效益，推进农业基础设施建设，强化农业综合开发项目的管理，促进社会主义新农村建设为目标，对本市2005至2007年度农业综合开发项目和资金使用管理情况进行审计，促进地方各级政府、有关部门和单位加强涉农投资项目管理，完善管理制度，提高资金使用效益，扎实推进社会主义新农村建设。
7．住宅配套费专项资金归集、使用和管理情况审计。以规范住宅配套费专项资金管理，促进提高资金使用效益，推动建设和谐社会为目标，对2005至2007年本市住宅配套费专项资金的归集、使用和管理情况进行审计，促进完善住宅配套费专项资金管理制度，提高住宅配套费专项资金使用管理的合规性、效益性和效果性，切实推进和谐社会建设。
8．民防专项资金归集、使用和管理情况审计。以规范民防专项资金管理，提高资金使用效益，促进加强民防工程建设对未来战争防御和防灾减灾的作用，维护国家安全和社会稳定为目标，对2005至2007年本市民防专项资金的归集、使用和管理情况进行审计，促进完善民防专项资金管理制度，提高民防专项资金使用管理的合规性、效益性和效果性，切实维护国家安全和社会稳定。
9．政府投资和以政府投资为主的建设项目资金使用管理情况审计。以促进规范政府投资项目资金管理，提高财政性建设项目资金使用效益，推动城市基础设施建设，推进城市协调发展为目标，对中心区交通信息采集系统工程和上海市精神卫生中心改扩建工程等政府投资项目进行审计和跟踪审计，不断促进提高项目质量和管理水平。
10．本市院前急救系统建设项目实施情况审计调查。以促进加强院前急救系统建设，满足社会急救需求，提高城市急救服务水平，推动卫生医疗事业发展为目标，对本市院前急救系统建设项目实施情况进行审计调查，促进加强本市院前急救系统建设项目预算管理，提高应急救治能力，进一步推动本市医疗服务体系的完善。
11．政府采购实施情况审计调查。以规范政府采购程序，提高政府采购效益，促进强化政府管理职能为目标，对本市政府采购实施情况进行审计调查，推进建立健全公共财政体系，充分发挥财政资金的使用效益和社会效益。
12．环境保护专项资金使用、管理、效益及污染源监管情况审计调查。以加强环境保护和生态文明建设，提高环保专项资金使用效益为目标，对本市2005至2007年环境保护专项资金使用、管理、效益及污染源监管情况进行审计调查，促进规范环保专项资金的使用管理，增强污染源监管能力，提高环境保护项目投资效益，促进节能减排工作的落实。